在每年立秋的前五天和后五天之内施肥，最有利于韭菜的营养积累。过早施肥容易引起韭菜疯长，降低植株的抗逆能力，增加倒伏几率，再加上正值高温多雨，易导致疫病的发生，使韭菜烂根。过晚施肥则会因为温度的逐渐降低而使韭菜不能积累足够的营养。
为了保证韭菜当前的生长需求和今后的营养积累，施肥应掌握“三结合”原则，即速效肥与缓效肥相结合，大量元素肥与微量元素肥相结合，有机肥与无机肥相结合加喷施新高脂膜，大大提高肥的有效成分率。
选晴天下午，先进行一遍划锄，每亩地将复合肥40公斤、硫酸亚铁3.5公斤、硼砂1.5公斤、硫酸锌2.5公斤、硫酸锰2.5公斤，豆饼500～750公斤混合均匀，用1000倍的辛硫磷水溶液将混合后的肥料均匀喷透，在韭畦间撒匀后，再用半米长的5齿小耙伸入韭菜架底下顺垄划锄，尽量不要将有机肥暴露在地表，否则失去施肥的意义。最后，再顺垄浇大水一次，并在整畦叶面喷施辛硫磷或菊酯类药剂严防苍蝇下卵，隔5～7天再浇第二次水。注意，当年种植的新韭菜应趁韭叶尚未交叉封垄前，划锄2～3厘米，均匀施肥后再进行一次划锄和浇水。
浇过第二次水以后，应每隔7～10天进行一次追肥，以40公斤左右的复合肥为主，至寒露时停水控长，让韭菜积累营养，以备今年冬季与明年春季的生长需求。
