4月3日消息，近日，中国科学院天津工业生物技术研究所（以下简称天津工业生物所）与亚马逊云科技联合在天津举办“生物计算设计”沟通会，就生物技术与信息技术（BT+IT）结合助力合成生物学发展的现状和未来进行沟通交流。

早在2021年天津工业生物所成立了生物设计中心平台实验室，并围绕生物计算设计开始与亚马逊云科技共同探索生物技术和信息技术（BT+IT）相结合的技术体系，以进一步推动合成生物学发展，以期能够为在健康、能源、农业和环境等领域的科学研究提供技术支撑。至今已推出了全球首个基于图数据库的大肠杆菌调控代谢关系知识图谱ERMer和全流程高通量编辑序列设计云平台AutoESD等20多项生物计算设计网站工具。基于无服务器技术的云原生的开发方式较传统方式大幅缩短开发时间，总体运行成本大幅降低，使得团队可以专注于业务代码和创新。

基于图数据库的大肠杆菌调控代谢关系知识图谱ERMer

细胞中的代谢调控非常复杂，一个特定的细胞功能往往由一系列不同类型的代谢途径调控相互作用决定。例如，氨基酸的代谢通常由不同类型的相互作用组成的反馈或前馈回路来调节。由于缺乏对这些调控关系的全局性认识，对细胞进行代谢重塑时常触发胞内复杂调控而无法达到预期目标，这是目前细胞工厂构建中的存在的共性问题。

通常不同类型的调控数据散落在各个不同的数据库，生物学家很难通过仅关注与所研究的代谢物/蛋白质密切相关的一两类相互作用来识别这种复杂调控级联关系。因此，将这些不同类型的调控相互作用汇集在一起，并提供方便的交互方式，将极大的方便生物学家挖掘和理解生物体内的复杂调控关系。

对于这样的需求，传统的关系型数据库往往只能以非直接的方式来表示数据之间的关系，识别这种类型的复杂调控级联关系需要额外操作步骤且效率不高。相比之下，图数据库更适合这类异质性数据的管理和处理复杂查询。