近年来，重庆为打好种业“翻身仗”，大力实施种业振兴行动，成功培育农作物品种超过200个，耐热优质杂交水稻、优质糯玉米等良种覆盖率达96.5%，为全市粮食和重要农产品稳产保供作出重要贡献。但全市种业仍存在五方面短板，包括资金项目投入力度不够、种业企业竞争能力不强、种业基地供种能力较弱、科技创新支撑能力不足、种质资源仍在持续消亡等。
为此，《规划》立足重庆山地自然环境和种源优势，提出“3+2+9”种业发展思路。“3”即是三大种业创新平台：包括国家生猪技术创新中心、国家区域性生猪种业创新基地、长江上游种质创制科学装置；“2”即是两大现代农业（种业）产业园：包括现代农业（农作物种业）产业园、现代农业（畜禽种业）产业园；“9”即是九大优势特色种业高地：包括成渝地区双城经济圈核心区畜禽种业创新高地、武陵山区芥菜种业良繁和生猪种业创新双高地、渝东北平行岭谷区粮油良繁高地、渝西全国柑橘良繁高地、大巴山区马铃薯良繁高地、渝西北柠檬和蔬菜种业良繁高地、渝东南畜禽种业供种高地、三峡库区腹地特色水果种业供种高地、渝南山地蜂禽种业供种高地。
此外，《规划》还制定了包括种质资源保护利用、科技创新、企业扶优、基地建设和市场净化五大行动19项重点任务，力争到2025年，农业种质资源保护利用体系基本建成，市场化、标准化、智能化、高质量发展的种业体系初步形成，主要农作物良种覆盖率提高至98%，良种在农业增产中的贡献率超过50%。
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